Итоги деятельности Счетной палаты в 2000-2008 годах свидетельствуют об эффективности ее работы по выявлению потерь финансовых ресурсов государства, возврату незаконно израсходованных средств, подготовке предложений по устранению причин существующих недостатков. Это позволяет сделать вывод о том, что Счетная палата стала инструментом, с помощью которого общество реально осуществляет пристрастный аудит своего государства.
Всего за 2000-2008 годы Счетная палата провела 4108 контрольных мероприятий (в 2000 году - 390, в 2008 году - 320).
В ходе контрольных мероприятий выявлено нарушений законодательства в финансово-бюджетной сфере на сумму 1128,3 млрд. рублей (в 2000 году - 63,17 млрд. рублей, в 2008 году - 96,6 млрд. рублей). За 2000 - 2008 годы в результате принятых мер устранено финансовых нарушений на сумму 118,9 млрд. рублей, из них в 2008 году - 1,0 млрд. рублей.
По результатам контрольных мероприятий в 2000-2008 годах Счетной палатой было направлено органам государственной власти, предприятиям и организациям 3849 представлений и предписаний. По выявленным фактам нарушения законодательства 782 материала были направлены в Генеральную прокуратуру Российской Федерации и иные правоохранительные органы, возбуждено 1090 уголовных дел.
В 2000-2008 годах было проведено 440 заседаний Коллегии Счетной палаты (в 2000 году - 44, в 2008 году - 60). Рассмотрено 6114 вопросов (в 2000 году - 638, в 2008 году - 825), в том числе 3365 - по результатам контрольных мероприятий (в 2000 году - 332, в 2008 году - 395).
Отчеты о результатах всех контрольных мероприятий после утверждения Коллегией направляются в Совет Федерации и Государственную Думу Федерального Собрания. В обеих палатах Федерального Собрания созданы структуры по взаимодействию со Счетной палатой: комиссия в Совете Федерации, подкомитет в Госуда рственной Думе.